中国科学技术大学的孙成教授及其团队近期的研究发现，分析肿瘤微环境中免疫细胞的空间分布可以精准预测肝癌患者的术后复发风险。这项发表在《Nature》的研究论文《Spatial Immune Scoring System Predicts Hepatocellular Carcinoma Recurrence》创新性地结合了空间转录组学、蛋白质组学和多重免疫组化技术，开发出了全球首个针对肝癌复发的预测模型——TIMES评分系统，揭示了肿瘤微环境中免疫细胞的空间分布与肝癌复发之间的直接关联。同时，文中采用的高分辨率空间转录组技术（DSP-WTA）得到了非因生物团队的支持。

一、数据收集与空间异质性解析
研究利用10xVisium技术对17例HCC组织进行空间转录组分析，分别将组织划分为肿瘤侵袭前沿（IF）、中心（TC）和邻近基质（AS）三个区域，并鉴定了NK细胞在IF和TC中的富集差异。此外，通过多重免疫组化（mIHC）验证了61例患者的NK细胞亚群，发现CD3⁻CD57⁺成熟NK细胞与预后显著相关。

二、生物标志物筛选与模型构建
基于XGBoost算法，研究团队构建了TIMES评分系统，整合了IF和TC区域中五个生物标志物的空间表达模式，从而生成0-1分的风险评分。

三、功能验证与机制研究
通过3D生物打印模型模拟肿瘤微环境，验证了SPON2⁺NK细胞通过IFNγ激活CD8⁺T细胞的机制。同时，采用Spon2敲除小鼠模型显示NK细胞特异性缺失SPON2会导致肿瘤生长加速（P=78×10⁻³）和免疫浸润减少，进一步证实其抑癌功能。

四、多中心验证与临床转化验证
研究在231名患者的多中心队列中进行验证，结果显示TIMES评分的准确率达82.2%，AUC=0.82，显著优于传统的TNM（0.51）和BCLC（0.53）分期系统。分层分析显示TIMES对早期HCC（TNM期）的预测效果尤为突出（P=30×10⁻⁷）。对于接受抗PD-1治疗的患者，高TIMES评分者的缓解率显著更高（P=161×10⁻³），这意味着TIMES评分可能作为免疫治疗疗效的预测指标。

研究表明，TIMES评分作为一种潜在的HCC复发预后工具，整合了空间免疫信息，从而超越了传统临床因素的局限，为风险分层提供了新的视角。文中所揭示的生物学见解为未来研究SPON2+NK细胞在HCC生物学中的作用提供了新的方向。随着研究者对TIMES在其他癌症类型中的适用性进行探索，这项工作为早期HCC以及其他实体瘤的个性化管理策略打下了基础。

非因生物团队的研究成果利用了DSP-WTA空间全转录组技术，对肝癌组织中CD3−CD57+NK细胞进行单细胞级空间解析，结合单细胞测序、机器学习等方法筛选出了与复发密切相关的五个关键基因，为开发基于空间免疫信息的TIMES评分系统奠定了基础。非因DSP数字空间多组学技术能够在组织形态学染色的指引下，以空间分辨率的数据揭示特定区域内基因（18000种）和蛋白质（570种）的精确位置和表达水平，助力科研工作者深入解析肿瘤的异质性及其微环境。非因生物在空间多组学领域拥丰富的项目经验，完成了超过60种特染抗体的开发，并为300多项目提供服务，助力发表了超过40篇空间多组学相关的学术文章，累计影响因子超过522，平均影响因子14以上。该公司配备了3台高效运行的DSP仪器，成为国内规模最大的DSP数字空间多组学技术服务提供商。