文库制备新技术在生物医疗研究中的应用

文库制备是生物医疗研究中不可或缺的一环，其关键在于将测序接头添加到DNA链上。传统的文库制备方法通常依赖于连接酶，这一「流程」涉及多个复杂步骤：首先通过机械（如超声破碎）或酶切（如micrococcal nuclease）对DNA进行片段化，接着进行末端修复，最后完成接头的连接。尽管此方法适用于许多实验场景，但在样本量有限或实验资源受限的情况下，往往会面临诸多挑战。

为此，新的Tagmentation技术为文库制备提供了创新的解决方案。该方法采用了超活性Tn5转座酶，允许在单次快速反应中同时剪切和标记DNA，显著提高了实验效率。根据具体需求，Tn5转座酶可以承载多种DNA序列，包括兼容Illumina的接头、带有荧光标记的自定义接头以及甲基化核苷酸等。这种基于Tagmentation的建库技术将传统的片段化、末端修复与连接步骤整合为单一反应，大大简化了文库制备过程。

通过将DNA片段化与接头插入步骤合并，该技术显著缩短了操作时间，并降低了技术的复杂性。其应用范围广泛，兼容全基因组测序和靶向测序等多种建库场景，能够灵活适应不同实验设计的需求。此外，单步反应替代传统的多环节操作，使得建库速度显著提升，特别适合处理珍贵的临床样本或微量样本。

在成本经济性方面，Tagmentation技术通过减少操作步骤和试剂消耗，整体降低了建库成本。同时，基于其简单的操作流程和减少的步骤，使得该技术更容易实现自动化，从而显著提升高通量测序的效率和可重复性。

Spatial-ATAC-seq与sci-RNA-seq技术的创新应用

在空间生物医学研究中，作者开发了spatial-ATAC-seq方法，用于分析完整组织切片中的染色质可及性，并实现细胞层面的空间信息保留。在该protocol中，使用了Diagenode的Tn5转座酶（Cat#C01070010）进行文库制备。

此外，针对单细胞转录组分析，sci-RNA-seq方案也进行了简化和优化。此技术通过分别对单个细胞核内的核酸进行逆转录、连接和Tagmentation的步骤，达到了对mRNA/cDNA添加三重indexes的目的。在这里，同样使用了Diagenode的Tn5转座酶以增强文库的制备效率。

Diagenode与尊龙凯时的合作前景

Diagenode公司成立于2003年，是全球知名的表观遗传学产品制造商，也是二代及三代测序前样本处理领域的专家。作为“尊龙凯时”的战略合作伙伴，Diagenode致力于提供创新的表观遗传学解决方案和高效的实验工具，包括Bioruptor破碎仪和IP-Star自动化仪器，以简化DNA甲基化、ChIP和ChIP-seq的工作流程。

总的来说，基于Tagmentation技术的文库制备方法和Diagenode的高通用性转座酶，不仅提升了实验效率，也为生物医疗研究带来了新的可能性。“尊龙凯时”品牌在这一领域的高质量产品，使得实验室能够更有效地进行研究，不断推动科学的进步。